Debido a las duras condiciones ambientales que reinan en las islas Cíes (viento, insolación, sequedad, escasez de nutrientes, salinidad...), el número de especies de plantas, árboles, etc. que aquí habitan es escaso; sin embargo su valor ecológico es muy alto, por tratarse de especies exclusivas de este ecosistema y, sobre todo, por ser capaces de adaptarse a este tipo de ambiente tan hostil.

En el archipiélago observamos especies desaparecidas en el resto de Galicia.

Alguna de las adaptaciones que han tenido que llevar a cabo las plantas son:

1. Raíces muy profundas, en busca de agua subterránea.
2. Pelillos en las hojas para evitar la desecación.
3. Tejidos carnosos para almacenar agua.
4. Colores claros para reflejar la luz solar.
5. Bulbos o rizomas en las raíces como reserva alimenticia.
6. Presencia de bacterias fijadoras de nitrógeno atmosférico.
7. Engrosamiento de los tejidos como medio de defensa mecánica.
8. Enrollamiento de las hojas, evitando la evaporación.

Algunas especies:

1. Angélica, hierba del espíritu santo o raíz de larga vida (angelica archangelica): Planta con tallo grueso bastante ramificado; sus flores son blanco-verdosas. Alcanza una altura entre 1,40 y 2,30m. En las Cíes, se encuentra en los acantilados; pero es raro encontrarla en España. Tiene diversas aplicaciones terapéuticas.
2. Armeria o herba namoradeira (armeria pungens): arbusto de hasta 50cm de alto. Se encuentra en el suroeste de la Península Ibérica, Islas Cíes, Sur de Portugal, Córcega y Cerdeña. En épocas pasadas, el clima de la costa gallega era más cálido, lo que permitió a esta especie avanzar desde el sur; posteriormente retrocedió debido a la variación del clima.
3. Barrón o feo da praia (ammophila arenaria): planta perenne con tallos de 60-120cm de alto y dotada de rizomas. Gracias a sus raíces, que pueden llegar a más de 4m de profundidad, es una de las primeras colonizadoras de las dunas.
4. Camarina o camariña (corema album): arbusto de hasta 1m de altura bastante ramificado. Se trata de una especie única del litoral occidental ibérico y Azores. En las dunas de las Cíes, se encuentra la mayor y más importante población de Galicia. Catalogada como especie vulnerable.
5. Cardo de mar, cardo marino o cardo da ribeira (eryngium maritimum): planta perenne de hasta 60cm. Destaca por su flor azul metálico. Es típica de las regiones costeras de Europa.
6. Correhuela rosa (convulvus althaeoides): planta perenne propia de los suelos arenosos. Puede alcanzar los 2,5m. Sus flores son de color rosa vino muy vistosas. Sus tallos se enroscan a otras plantas. Se encuentran al lado de los caminos.
7. Carpaza, jaguarzo morisco, jara negra o tomillo blanco (cistus salvifolius): arbusto de hoja perenne que alcanza 1m de altura. Su follaje es aromático. Se trata de una especie de los países mediterráneos. Soporta bien las fuertes insolaciones y, además, puede sobrevivir en suelos pobres. Tiene propiedades medicinales como astringente y también cicatrizantes.
8. Carraspique o cestillo de plata (iberis procumbens): planta perenne siempreverde, de 20-30cm de altura, con tallo sufruticoso. Son muy resistentes al calor y a la sequía; también soportan cierto frío. Estas plantas son exclusivas del litoral meridional y occidental de la península ibérica.
9. Castaño (castanea sativa): árbol de hoja caediza, tronco grueso y madera dura. Puede pasar de los 30m. Se dan en todos los suelos, pero prefieren los frescos y profundos. En Galicia se cultiva por sus frutos (base de la alimentación gallega, tanto de personas como de animales, durante mucho tiempo) y por su madera (base de la construcción gallega, en puertas, vigas, tejados, etc).
10. Endrino (prunus spinosa l.): arbusto perenne, de la familia de los rosáceas. Generalmente no pasa de mata o arbusto, pero puede llegar a constituir un arbolillo de hasta 6m de altura. Sus flores son blancas y sus frutos -los prunos- son de color azul muy oscuro. Especie nativa de Europa y Oeste de Asia.
11. Esparraguera (asparagus plumosus): planta trepadora de color verde, con tallos finos y verticales. Puede alcanzar los 5m de altura. Tiene su origen en Sudáfrica. Se utiliza mucho en floristería como complemento en la confección de arreglos florales.
12. Eucalipto macho o eucalipto medicinal (eucalyptus globulus): árbol perennifolio que puede alcanzar los 60m de altura. Es sensible a las sequías prolongadas; prefiere suelos ligeramente ácidos y frescos. Es originario de Australia; existen más de 300 especies de eucaliptos. Tiene propiedades antisépticas, balsámicas, estimulantes, etc.
13. Fresno común o fresno europeo (fraxinus excelsior): árbol caducifolio con una altura de 8 a 12m(aunque, en algunos casos, puede alcanzar los 40m). Prefiere las zonas frescas (con bastante humedad) ya que no tolera los climas secos y calurosos. Sus hojas tienen propiedades diuréticas y laxantes, incluso antirreumáticas si se mezclan con otras plantas.
14. Hinojo marino o perejil de mar (crithmum maritimum): planta perenne de color verde con tallos flexibles, que mide entre 15 y 45cm. Se encuentra en grietas y rellanos de acantilados; a veces también en zonas arenosas, aunque muy raramente. Es muy rico en minerales y vitamina C. Era utilizado por los marineros para luchar contra los escorbutos tras largos viajes.
15. Jaguarzo negro (cistus monspeliensis): arbusto perennifolio de color verde, de talla mediana, muy ramificado. Sus flores son blancas con 5 pétalos, de forma triangular y algo escotados en su parte exterior. Es poco exigente en cuanto al suelo; aguanta bien las heladas y solanas.
16. Nardo marítimo, azucena de mar o cebola das gavotas (pancratium maritimum): planta perenne, de entre 30 y 70cm de alto, con raíz bulbosa. Tolera bien los largos períodos de sequía. Se encuentra en las Costas del Atlántico y del Mediterráneo. Antiguamente se utilizaba como purgante.
17. Pino insigne o de Monterrey (pinus radiata): árbol perennifolio (o verde todo el año) que alcanza una altura de 30 a 40m; su corteza es de color negro. Prefieren los climas suaves con abundante humedad atmosférica. Fueron repoblados en el archipiélago en la década de los cincuenta. Es originario de California -costa occidental de Estados Unidos-. Su madera se utiliza sobre todo en la industria de la celulosa.
18. Pino marítimo o rodeno (pinus pinaster): árbol perennifolio que alcanza los 30-40m de altura; su corteza es gruesa y de color marrón rojizo. Su madera de no es de mucha calidad, pero es un gran productor de resina.
19. Retama mansa (Osyris alba): arbusto que alcanza un tamaño máximo de 2m. Sus flores son de color verdoso y su fruto es una drupa de color rojo, del tamaño de un guisante. Viven en zonas húmedas y soportan todo tipo de suelos.
20. Roble melojo (quercus pyrenaica): especie arbórea autóctona. Árbol de hoja caduca que no suele pasar de los 20m de altura. Su fruto es la bellota. Soporta muy bien las heladas. Puede vivir entre 500 y 600 años. Es un árbol escaso, por la tala abusiva y la competencia de especies foráneas.
21. Tomillo bravo (helichrysum picardii virescens): arbustillo que llega a los 50cm de altura. Crece en todo tipo de suelos y soporta bastante bien la sequía. Es una planta originaria de las costas occidentales ibéricas, exclusivamente. Tiene en Galicia su límite más norteño. Posee gran cantidad de propiedades medicinales.
22. Tojo (Ulex europaeus): arbusto muy ramificado y espinoso que puede alcanzar una altura de 2m. Sus flores son de color amarillo. Se adapta perfectamente a suelos pobres y secos; prefieren los climas templados. Tiene propiedades medicinales como diurético, antimigrañoso, etc.